未来星际，无数异兽入侵，吞食异兽就能获得基因，人类于是迎来了基因大进化时代。刚进庇护所的新人韩森，表面上是遭人鄙视的存在，另一面却是人人敬仰的“B神”！韩森：不好意思，只有我能获得超级神基因！
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蓬莱岛，相传为古时候的神之岛，秦始皇曾派徐福及三千童男童女寻找蓬莱，以觅长生不老之方。岛上生活着人类、妖怪和半妖，他们和睦相处，自由自在。为了防止半妖受到伤害，巫女奏使用法术使蓬莱岛隐藏起来，每隔50年才会伴着浓雾出现一次。然而邪恶的四斗神趁小岛结界虚弱之际潜入，污染鸣动之窑，对岛上居民进行无情统治和屠杀。在戈薇到达战国时代的50年前，犬夜叉曾和桔梗乘船登上蓬莱，结果遭遇四斗神。在交战中，犬夜叉的力量被四斗神封印。
在奥克兰，三个孩子遭遇了奇异的彩虹，通过彩虹的能量波动穿越到了中国。因为他们的莽撞之举，造成了这个世界的能量失衡。在中国获得帮助的他们，最终克服了重重障碍让这个世界恢复了原有的模样，同时也获得了成长与友谊。
